Начиная с 1 июня 2010 года в связи с повышением тарифов в обслуживающем банке вводится дополнительный платеж в сумме 15 рублей за оформление платежного поручения при выводе средств из WebMoney на счет физического лица в банке. Этот платеж взимается в фиксированной сумме сверх стандартной комиссии в размере 0,8% с выводимой суммы. При этом сумма стандартной комиссии не может превышать полутора тысяч рублей. При зачислении денежных средств на банковский счет физического лица банк снимает свою комиссию, средняя величина которой составляет от одного до двух процентов от перечисленной суммы. Но все же WebMoney по прежнему остается одной из наиболее дешевых систем электронных платежей. Так для сравнения можно привести размер комиссии в системе "Яндекс.Деньги", который составляет три процента плюс десять рублей, и это без учета комиссии банка, в котором открыт счет у физического лица. Так что введение дополнительного платежа вероятно не снизит популярность системы WebMoney.